Verksamheterna i Landstinget i Östergötland är indelade i ett femtontal olika enheter. Fem av dessa ansvarar för den specialiserade vården, som är länsövergripande och bedrivs vid tre sjukhus i Östergötland: Universitetssjukhuset i Linköping, Vrinnevisjukhuset i Norrköping och Lasarettet i Motala. Satsningen på Universitetssjukhuset i Linköping ger hela regionen tillgång till effektiv högspecialiserad vård.
Fyra produktionsenheter ansvarar för närsjukvården, som finns i olika delar av länet (östra, västra och centrala Östergötland samt Finspång). Här bedrivs viss vård på sjukhusen i länet och på länets 42 vårdcentraler (privata eller landstingsägda verksamheter).
Folktandvården ger lokal tandvård vid de 41 kliniker som finns för allmäntandvård, specialisttandvård och sjukhustandvård.
Utöver de verksamheter som bedriver vård finns sex stöd- och serviceenheter, som ger stöd åt och utvecklar landstingets samlade verksamhet.