Miljöarbetet vid sjukhusen bedrivs dels i enlighet med den miljöpolitiska ledningsplanen och dels utifrån de lagstadgade krav som finns. Bl.a. finns bestämmelser om egenkontroll som innebär att sjukhusen som verksamhetsutövare genom rutiner, åtgärder m.m. ska efterleva sina tillståndsbeslut och kontrollera hur miljön påverkas. Sjukhusen har upprättat egna miljöprogram med mål för miljöarbetet. Till hjälp för det dagliga miljöarbetet finns bl.a. Nya Miljöhandboken med tips om vad man kan göra för att förbättra miljön både på arbetet och hemma.
Vid sjukhusen genomförs olika projekt för att förbättra miljöarbetet. Universitetssjukhuset i Linköping, US, har infört sortering av köksavfall som Tekniska Verken i Linköping sedan använder i sin biogasanläggning. Utvecklingen av det interna miljöledningssystemet vid US pågår.
Vid Vrinnevisjukhuset i Norrköping, ViN, pågår planering och projektering av en miljöstation för källsortering av avfall. Dessutom utreds alternativt omhändertagande av köksavfall från centralköket genom kompostering. Kartläggning av farligt avfall har skett och rutiner för hantering av farligt avfall har utarbetats.
Röntgenavdelningen på Lasarettet i Motala, LiM, har till viss del övergått till digitaliserad röntgen, vilket minskar användningen av kemikalier.