Landstingets forskning och utveckling bedrivs i bred samverkan med andra verksamheter, för utbyte av kunskaper och erfarenheter och för att få bästa utdelning av tillgängliga resurser. Linköpings universitet är en självskriven samarbetspartner med tyngdpunkt i Hälsouniversitetet. Inom Sydöstra Sjukvårdsregionen bedrivs ett stort antal gemensamma projekt, framförallt kring kliniska och patientnära problem. FoU-samarbetet med kommunerna rör främst de prioriterade grupperna inom hälso- och sjukvården där kommuner och landsting har delat ansvar. Andra samarbetspartners är institut och organisationer som bidrar till kunskapsutveckling som är viktig för landstinget.