Landstinget och Linköpings universitet har ett gott samarbete som främst tagit sig uttryck i utvecklingen av Hälsouniversitetet. Detta samarbete regleras i olika avtal. Nya centrala och regionala avtal kring läkarutbildning och forskning har tecknats med staten resp. Linköpings universitet (ALF- resp. RALF-avtal). Läs mer
För att ta tillvara landstingets och universitetets resurser på bästa sätt ska den statliga ersättningen och landstingets anslag till specificerade FoU-insatser prioriteras gemensamt. För 2004 disponerades ca 38 miljoner kr för 739 projektansökningar av vilka 305 beviljades. Övriga medel, bland annat produktionsenheternas avsatta FoU-medel och universitetets anslag för läkarutbildning och forskning, disponeras av parterna; öppet och i samråd.