I Specialistsjukvården ingår kliniker som du som patient oftast kommer till via remiss från en läkare på vårdcentralen. Resurserna inom specialistsjukvården är i första hand avsedda för att utreda och behandla patienter som har en sjukdom som kräver ytterligare specialkunskaper. På landstingets sjukhus i Motala, Linköping och Norrköping finns kliniker med mottagningar och vårdavdelningar som ingår i specialistsjukvården. Samtidigt innebär det att vissa specialiteter bara finns vid ett eller två av länets sjukhus.